În hipospadiasul izolat se asociază rar altă anomalie decât testicolul necoborât (5-10% din cazuri).Frecvenţa cazurilor de malformaţii de tract urinar superior (rinichi sau/şi uretere) la pacienţii cu hipospadias este de 2%. În 20% a cazurilor severe de hipospadias se asociază un utricul prostatic mărit ( o dilatare în deget de manusa pe uretra posterioară).